이 질문 뒤에 면접관이 확인하려는 것은 따로 있습니다.
미생물 생태학 수업 실습에서 분변 샘플로부터 DNA를 추출하고 16S rRNA 앰플리콘 시퀀싱 데이터를 분석하는 과정을 진행했습니다. 추출 단계에서 샘플 보관 온도가 DNA 품질에 영향을 준다는 것을 처음 확인했습니다.
QIIME2 파이프라인으로 OTU 클러스터링과 다양성 지수 계산을 수행했습니다. 알파 다양성과 베타 다양성이 다른 질문에 답한다는 것을 분석하면서 이해했습니다. 샘플 수가 적어 통계 검정 결과를 단정적으로 해석하기 어려운 한계가 있었고, 이를 논의 섹션에 명시했습니다. 면역 실험 쪽은 ELISA 기초 실습 정도만 해봤고, 유세포 분석 같은 고급 기법은 경험하지 못했습니다. 마이크로바이옴 분석 흐름을 처음부터 끝까지 경험한 것이 이 분야에서의 출발점이 됐다고 생각합니다.
마이크로바이옴 기초 실험에서 제가 직접 한 건, 분변 샘플에서 DNA를 추출하고 16S rRNA 앰플리콘 시퀀싱 데이터를 QIIME2로 분석한 일입니다. 추출 단계에서 샘플 보관 온도가 DNA 품질에 영향을 준다는 걸 처음 확인했습니다. 그다음 QIIME2 파이프라인으로 OTU 클러스터링과 다양성 지수 계산을 수행했고, 알파 다양성과 베타 다양성이 서로 다른 질문에 답한다는 걸 분석하며 이해했습니다. 막연히 실험을 했다가 아니라, 추출부터 다양성 계산까지 흐름을 제 손으로 거친 게 핵심이었습니다. 다만 한계도 솔직히 인정합니다. 샘플 수가 적어 통계 검정 결과를 단정적으로 해석하기 어려웠고, 그 한계를 논의 섹션에 명시했습니다. 면역 쪽은 ELISA 기초 실습 정도만 했고 유세포 분석 같은 고급 기법은 경험하지 못했습니다. 마이크로바이옴 분석 흐름을 처음부터 끝까지 거친 게 이 분야의 출발점이었습니다. 그래서 다양성 지수를 계산한 경험을 토대로, 그 실험·분석 역량을 더 키우려 합니다.
마이크로바이옴 실험에서 제가 직접 굴린 자리는, DNA 추출 단계에서 샘플 보관 온도가 품질을 좌우한다는 걸 확인한 부분입니다. 분변 샘플로 16S rRNA 시퀀싱을 준비하며, 보관이 잘못된 샘플은 추출 DNA의 품질이 떨어져 뒤의 분석 전체가 흔들린다는 걸 봤습니다. 그래서 저는 분석 기법보다 먼저, 입력 샘플의 보관과 품질을 챙기는 게 결과의 신뢰를 좌우한다고 봤습니다. 이후 QIIME2로 OTU 클러스터링과 다양성 지수를 계산했습니다. 막연히 실험을 했다가 아니라, 어느 단계의 품질이 결과를 좌우하는지를 직접 겪은 게 핵심이었습니다. 다만 한계도 인정합니다. 샘플 수가 적어 통계 해석에 한계가 있었고 그걸 논의에 명시했습니다. 또 면역 쪽은 ELISA 기초만, 유세포 분석 같은 고급 기법은 경험이 없습니다. 그래서 샘플 보관의 영향을 본 경험을 토대로, 그 실험 역량을 더 키우려 합니다.
답변에서 흔히 빠지는 것들 — 빠져 있으면 꼬리질문이 깊어집니다.
이 질문에 이어 고려대학교의료원 바이오·제약 연구 면접관이 던질 가능성이 높은 후속 질문.
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